在水果长途运输的过程中，包装对其保护起到了至关重要的作用。好的包装可以使水果在经历长途运输之后仍然保持其完好新鲜，而不好的包装材料常常让货主付出惨重的损耗。水果包装分外包装和内包装两种，只有内外结合，相互补充，才能更好地保护水果，减少损耗。
目前，我国水果采用的外包装材料很多，主要可分为以下几种类型：
筐：用竹子、荆条等天然植物材料编的筐是我国的传统包装容器。这种材料的主要优点是便宜、轻便，就地取材，几乎可以编成任意形状和大小的容器。缺点是形状不规则，往往不很坚实。因而不足以防止损伤的发生；尺寸较大，用人工装御易疲劳；形状通常是上大下小，虽然能减少下层果实承受的压力，但在运输和贮藏中难以有效地堆码。
木箱：木箱比其他天然植物材料制成的容器要好，订优点是结实，可以制作成各种规格统一的形状，比其他材料防止物理损伤的能力要强。但是，木箱本身较重，操作和运输比较吃力。
纸板箱：瓦楞纸板箱是西方技术的产物，它轻便、便宜，因而作为木箱的替代物，大量出现在水果流通领域。纸板箱的另一个优点是它的外观更光滑便于使用印刷的标签和宣传品，纸板箱最大的缺点是不能重复使用，一经水浸蚀或加工粗放就容易受到损伤。
塑料箱：塑料箱可以用多种合成材料制成，但主要是由以下两种材料制成的：较硬的高密度聚乙烯型、较软的低密度聚苯乙烯型。高密度聚乙烯箱，结实，强度高，很容易经受得起流通中在一般情况下所能遇到的各种压力，并且能堆码一定高度；同时，由于这种箱子能较容易地制造成统一的规格，因而能最大的利用贮藏空间；强度大，在设计上有较大的灵活性，还可以在箱壁上增加拉手和通风孔等，而不会削弱仃子的机械强度。此外，易于清洗，外表光滑，可以制成多种明亮的颜色。如果设计时使箱子能相互套起来，那么空箱子所占空间就只有满箱子的三分之一左右或更少。
人们认为这些塑料箱在满足新鲜水果蔬菜流通要求方面具有较理想的技术特性，所以在任何一个包装开发项目中都被当作传统包装容器的替代物。但是，聚乙烯材料很贵，只有在能有效地组织回收并使之多次利用的情况下，使用这种箱子在经济上才是可行的。
以上几种包装材料主要是制做包装容器，以抵抗来自外界的损害，属于商品外包装。在包装容器内，各个商品之间还可能造成相互碰撞或商品与容器碰撞，这种运动也会给产品带来物理损伤。用于内包装的材料主要有：
植物材料：像叶子这类植物材料是农村地区最便宜的内包装。它们主要是用于衬垫，在保护商品方面十分有效。我国很多地方用叶子做为筐装商品的内包装。但是，植物材料是生物组织，因而就要呼吸，它们的呼吸能影响商品，提高包装容器中的聚热程度，扩大微生物的传染。
纸：纸作为内包装材料应用得很普遍，最便宜的是旧报纸。纸与植物叶子所起的作用基本是一样的，但纸衬垫以外还可用于包装商品。与植物材料相比，纸在保护商品方面不一定更有效，可是它不会与产品发生任何不好的相互作用，并且可以较明显地改进商品在市场上的外观视觉。
内包装纸种类很多，有包纸、纸托盘、瓦楞插扳板纸等。包纸可以用来保护单个商品，也可用做采后化学处理携带体。纸托盘和插板可以用来分离产品的行数或作为分离容器的额外衬垫，插板纸也可以在包装容器内做成糟或格，使每个商品个体之间完全隔离。
塑料：使用塑料内包装的方法与纸是一样的，种类很多，它比纸包装更吸引人，并且在控制商品失水和呼吸方面有显着的优势，但成本较高。人们也用柔软的刨花，泡沫塑料或纤维表素层等做内包装。
总之，包装物选择受到果蔬产品本身成本的限制，要考虑产品价值，包装物成本以及对保护产品质量的作用，销售价格等因素。用于水果蔬菜包装最便宜的材料是用土生土长的植物材料做成的筐和袋子。但实际情况告诉人们，使用这种包装，产品受到相当程度的物理损伤。
